
Zakład Biotechnologii
Kierownik
dr hab. Edyta Juszczuk-Kubiak, prof. IBPRS-PIB
e-mail: edyta.juszczuk-kubiak@ibprs.pl
ORCID: https://orcid.org/0000-0001-5093-5320
Zakład Biotechnologii funkcjonuje w strukturach organizacyjnych Instytutu Biotechnologii Przemysłu Rolno-Spożywczego – Państwowego Instytutu Badawczego od 1 stycznia 2025 roku. Powstał na bazie Pracowni Biotechnologii i Inżynierii Molekularnej, działającej od 2020 roku. Zakład Biotechnologii (ZB) kontynuuje interdyscyplinarne badania podstawowe i aplikacyjne w zakresie biotechnologii, inżynierii genetycznej, mikrobiologii eksperymentalnej oraz biologii molekularnej i komórkowej. Integrujemy te dziedziny z technologią żywności, żywieniem człowieka i zdrowiem konsumenta, dążąc do opracowania innowacyjnych rozwiązań o rzeczywistym potencjale wdrożeniowym, które mogą znacząco wpłynąć na rozwój przemysłu oraz poprawę jakości życia społeczeństwa.
Struktura badawcza Zakładu Biotechnologii
Zakład Biotechnologii składa się z trzech wyspecjalizowanych Pracowni, które pełnią kluczową rolę w realizacji naszych celów naukowych:
- Pracownia Inżynierii Genetycznej – zajmuje się badaniami i rozwojem nowoczesnych technik inżynierii genetycznej, w tym edycji genomu przy użyciu narzędzi takich jak CRISPR-Cas. Specjalizujemy się także w optymalizacji protokołów edycji genów, głównie w kontekście organizmów prokariotycznych.
- Pracownia Genomiki Funkcjonalnej – koncentruje się na badaniach związanych z funkcjonowaniem genów i ich interakcjami w organizmach żywych. Wykorzystujemy zaawansowane metody genomiczne, transkryptomiczne, biologii molekularnej, genetyki i analizy in silico do modelowania interakcji genów oraz przewidywania skutków modyfikacji genetycznych.
- Laboratorium Hodowli Linii Komórkowych in vitro – specjalizuje się w hodowli linii komórkowych, które wykorzystywane są do badań nad bezpieczeństwem żywności, oceną cytotoksyczności związków chemicznych oraz badaniami nad mikrobiomem jelitowym.
Zakres badań
W Zakładzie Biotechnologii prowadzone są badania w ramach kilku kluczowych obszarów, które są zgodne z priorytetowymi kierunkami badawczymi IBPRS-PIS:
1. Rozwój technik biotechnologicznych
– Badania podstawowe i aplikacyjne w zakresie inżynierii genetycznej i molekularnej, ze szczególnym uwzględnieniem edycji genomu z wykorzystaniem CRISPR-Cas. Naszym celem jest optymalizacja protokołów edycji genów prokariotycznych i ocena ich efektywności.
– Wdrożenie innowacyjnych technik inżynierii genetycznej i metabolicznej w celu nadprodukcji rekombinowanych białek/enzymów o właściwościach terapeutycznych i przemysłowych.
– Rozwój metod analizy bioinformatycznej, które wspierają procesy edycji genomu, w tym modelowanie interakcji genów i predykcję skutków modyfikacji genetycznych.
– Współpraca z innymi zakładami biotechnologicznymi w celu opracowania procesów modyfikacji i ekspresji rekombinowanych białek na skalę przemysłową.
2. Bezpieczeństwo żywności i zdrowie konsumenta
– Badania nad bezpieczeństwem żywności, w tym oceną ryzyka zdrowotnego związanego z zanieczyszczeniami chemicznymi w żywności, które przeprowadzamy na poziomie molekularnym z wykorzystaniem modeli in vitro i ex vivo.
– Ocenę cytotoksyczności i genotoksyczności badanych związków chemicznych przy użyciu pierwotnych i ciągłych linii komórkowych oraz systemów genów reporterowych.
– Badania nad interakcjami między żywnością, żywieniem a mikrobiotą jelitową, ze szczególnym naciskiem na wykorzystanie hodowli mikrobioty ex vivo oraz technologię sekwencjonowania NGS.
– Badania nad biologicznym potencjałem szczepów probiotycznych i postbiotyków nowej generacji (NGP), w tym ich wpływem na zdrowie człowieka oraz równowagę mikroflory jelitowej.
– Optymalizacja systemów modyfikacji mikrobiomów w kontekście zdrowia człowieka w celu produkcji żywności funkcjonalnej i terapeutycznej.
– Badania nad wykorzystaniem szczepów probiotycznych o wysokim potencjale do produkcji biofunkcyjnych metabolitów i bakteryjnych neuroprzekaźników, które mogą być użyte do produkcji fermentowanej żywności o właściwościach terapeutycznych.
3. Komercjalizacja wyników badań
– Aktywne działania na rzecz komercjalizacji wyników badań, w tym współpraca z przemysłem w celu identyfikacji potencjalnych zastosowań biotechnologicznych w produkcji żywności oraz zapewnieniu jej bezpieczeństwa.
– Udział w targach branżowych, konferencjach oraz wydarzeniach networkingowych w celu nawiązania współpracy z inwestorami i przedstawicielami sektora spożywczego.
Ponadto działalność Zakładu Biotechnologii obejmuje aktywne pozyskiwanie funduszy zewnętrznych na prowadzenie interdyscyplinarnych badań w oparciu o współpracę z instytucjami naukowymi oraz przemysłem. Kadra Zakładu Biotechnologii aktywnie wspiera rozwój naukowy pracowników, doktorantów oraz młodych badaczy. Nowoczesne zaplecze badawcze oraz wysoki poziom merytorycznego przygotowania zespołu umożliwiają prowadzenie zaawansowanych badań, zdobywanie wiedzy, publikowanie wyników w renomowanych czasopismach oraz nawiązywanie międzynarodowej współpracy.
Współpraca i praktyki
Zakład Biotechnologii oferuje możliwość odbycia praktyk zawodowych oraz realizacji prac dyplomowych na poziomie inżynierskim, licencjackim i magisterskim. Nasza jednostka badawcza jest otwarta na współpracę z innymi ośrodkami naukowymi oraz sektorem przemysłowym. Zajmujemy się rozwojem innowacyjnych projektów badawczych, które mogą mieć znaczący wpływ na przyszłość biotechnologii i przemysłu spożywczego. Osoby zainteresowane współpracą zapraszamy do kontaktu z kierownikiem Zakładu.
Kontakt
Jeśli chcesz dowiedzieć się więcej o naszych badaniach lub współpracy, zapraszamy do kontaktu z kierownikiem Zakładu Biotechnologii.
dr hab. Edyta Juszczuk-Kubiak, prof. IBPRS-PIB
📩 e-mail: edyta.juszczuk-kubiak@ibprs.pl
📞 +48 603 507 330
📞WatsApp: +48 604 460 342
Google scholar: https://scholar.google.com/citations?user=3dcyKdUAAAAJ&hl=en
Pubmed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=juszczuk-kubiak+edyta&sort=date
Zespół
Kierownik
dr hab. Edyta Juszczuk-Kubiak, prof. IBPRS-PIB
e-mail: edyta.juszczuk-kubiak@ibprs.pl
ORCID: https://orcid.org/0000-0001-5093-5320
Google scholar: https://scholar.google.com/citations?user=3dcyKdUAAAAJ&hl=en
Pubmed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=juszczuk-kubiak+edyta&sort=date
mgr inż. Monika Kowalczyk
asystent/doktorantka w SD “AgroBioTech”, IBPRS-PIB
e-mail: monika.kowalczyk@ibprs.pl
ORCID: https://orcid.org/0000-0001-5093-5320
mgr. inż. Ewelina Zielińska
doktorantka w SD “AgroBioTech”, IBPRS-PIB
e-mail: ewelina.zielinska@ibprs.pl
inż. Mateusz Bąk
student
e-mail: mateusz.bak@ibprs.pl


REALIZOWANE PROJEKTY I TEMATY STATUTOWE
PROJEKTY
- Juszczuk-Kubiak E. „Innowacyjna technologia fermentacji śruty rzepakowej jako paszy dla trzody chlewnej”, nr 00043.DDD.6509.00042.2019.12, projektu realizowanego z udziałem środków Europejskiego Funduszu Rolnego na rzecz Rozwoju Obszarów Wiejskich w ramach Programu Rozwoju Obszarów Wiejskich na lata 2014-2020. Etap II/IV – „Ocena wpływu modyfikowanej paszy na profil mikrobiomu jelita trzody chlewnej ‒ korelacja ze zdrowiem i wydajnością hodowlaną i jakością surowca”, 2022-2023
- Juszczuk-Kubiak E. HORIZON 2020, H2020-LC-GD-2020-4, NeoGiANT–“The power of grape extracts: antimicrobial and antioxidant properties to prevent the use of antibiotics in farmed animals”, WP7, subtask 7.2.3 – “Effect of the gastrointestinal tract and immune system”, 2022-2025
- Juszczuk-Kubiak E. „Badania przyczyn wzrostu właściwości antyutleniających związków naturalnych występujących w żywności pod wpływem kompleksowania mikroelementami. Poszukiwanie efektywnych antyoksydantów w technologii żywności”, OPUS 20, 2020/39/B/NZ9/01894, 2021-2025
- Wójcicki M., Średnicka P., Juszczuk-Kubiak E., Szymielewicz D., Kowalczyk M., Emanowicz P. „Inkubator Innowacyjności 4.0, „Wykorzystanie bakteriofagów litycznych w eradykacji bakterii saprofitycznych w zakładach przetwórstwa spożywczego”, 2022-2023
- Kycia K., Juszczuk-Kubiak E., Choińska R., Bryła M., Roszko M., Piasecka-Jóźwiak K. „Premia granty na granty – promocja jakości III”, jednorazowy dodatek do wynagrodzenia osób biorących udział w opracowaniu wniosku projektowego do programu Horyzont 2020 „„Od ekologicznych i zdrowych przeżuwaczy do zdrowego mleka. Badanie zależności pomiędzy mikrobiomami zaangażowanymi w produkcję mleka surowego” (akronim: ECORUMIBIOM), (2022)
- Juszczuk-Kubiak E. „Premia na Horyzoncie 2”, numer umowy 590467/PnH2/2023, dodatek do wynagrodzeń dla osób biorących udział w realizacji projektu „Moc ekstraktów z winogron: właściwości przeciwdrobnoustrojowe i antyoksydacyjne w celu ograniczenia stosowania antybiotyków u zwierząt hodowlanych”, akronim: NeoGiANT, (2023-2025)
- Juszczuk-Kubiak E. „Potencjał psychobiotyczny Lactobacillus w projektowaniu terapeutycznych strategii żywieniowych” – „ Nauka dla Społeczeństwa II”, 2023-2026
TEMATY STATUTOWE
- Juszczuk-Kubiak E., Wójcicki M., Średnicka P., Sokołowska B. „Molekularna i funkcjonalna analiza regulacji ekspresji genów i modułów genetycznych biorących udział w quorum sensingjako systemowej odpowiedzi sygnałowej bakterii” (2020-2023), numer tematu: 136-01-ZM
- Wójcicki M., Świder O., Bujak M., Średnicka P., Kowalczyk M., Roszko M., Sokołowska B., Juszczuk-Kubiak E. Wykorzystanie bakteriofagów wobec Salmonella jako innowacyjnej metody zapewnienia bezpieczeństwa mikrobiologicznego żywności”; (2020-2023), numer tematu: 104-01-ZM
- Roszko M., Sokołowska B., Średnicka P., Juszczuk-Kubiak E. „Interakcje związków endokrynnie czynnych obecnych w żywności z mikroflorą jelitową człowieka w modelu in vitro”, (2020-2023), numer tematu: 142-01-ZM
- Kowalczyk M., Średnicka P., Roszko M., Juszczuk-Kubiak E. „Ocena obesogennego wpływu ftalanów jako zanieczyszczeń żywności i ich metabolitów na zaburzenia aktywności endokrynnej tkanki tłuszczowej – badania na modelu in vitro”; (2022-2025), numer tematu: 103-01-ZM
- Wójcicki M., Średnicka P., Juszczuk-Kubiak E. „Ocena wpływu wybranych czynników fizyko-chemicznych na infekcję fagową biofilmotwórczych bakterii saprofitycznych wyizolowanych z żywności minimalnie przetworzonej”; (2022-2022), numer tematu: 144-01-ZM
- Emanowicz P., Średnicka P., Roszko M., Juszczuk-Kubiak E. „Określenie potencjału szczepów bakterii probiotycznych następnej generacji Akkermansia muciniphila i Faecalibacteriaum prausnitzii w eliminacji BPF i TMBPF na poziomie bioadsorpcji i biotransformacji”; (2022-2023), numer tematu: 810-07-ZM
- Juszczuk-Kubiak E., Średnicka P. „Wpływ mikroflory jelitowej na heterocykliczne aminy aromatyczne (HAA) oznaczane techniką chromatografii gazowej z detekcją mas (GC-MS)”; (2022-2024), numer tematu: 115-01-ZM
- Juszczuk-Kubiak E. „Zastosowanie wysokiego ciśnienia hydrostatycznego (HPP) do inaktywacji alergenów selera i jabłek” (2022-2024), współpraca, dr Sylwia Skąpska (ZO), numer tematu: 106-01-ZM
- Juszczuk-Kubiak E. „Ocena biologicznego potencjału bakterii probiotycznych następnej generacji Akkermansia muciniphila i Faecalibacterium prausnitzii w neutralizacji obesogennej aktywności wybranych zanieczyszczeń chemicznych żywności” (2023-2025), numer tematu: 122-01-ZM
- Juszczuk-Kubiak E., Średnicka P. „Badanie potencjału fizykochemicznego oraz funkcjonalnego prebiotyków i związków śluzowych w lodach w aspekcie zrównoważonej diety” – współpraca, dr Joanna Markowska (ZJ) (2023-2025).
- Juszczuk-Kubiak E. „Próby opracowania nowych preparatów bakteryjnych z udziałem szczepów z gatunków Lactococcus lactis i Limosilactobacillus reuteri do zakiszania biomasy z przeznaczeniem na pasze i/lub biogaz” – współpraca, dr Katarzyna Piasecka-Jóźwiak, dr Renata Choińska (ZF) (2023-2025).
- Juszczuk-Kubiak E., Wójcicki M. „Ocena przydatności wybranych szczepów LAB do produkcji jogurtu o zwiększonej zawartości związków bioaktywnych” – współpraca, dr Katarzyna Kycia (GM) (2023-2025).